Prevádzkový proces zahusťovadla typicky začína zariadením na distribúciu náplne, ktoré zaisťuje rovnomerné rozdelenie kalu v nádrži, čím sa zabráni lokalizovaným oblastiam nadmernej koncentrácie alebo turbulentného prúdenia. V tomto štádiu sa pevné častice začnú vplyvom gravitácie pomaly usadzovať, zatiaľ čo číra kvapalina sa postupne oddeľuje a stúpa, čím sa vytvára vrstvená tekutá-pevná štruktúra. Aby sa zabezpečila optimálna účinnosť usadzovania, musí sa rýchlosť podávania udržiavať v primeranom rozsahu: nesmie byť taká rýchla, aby spôsobila, že častice v horných vrstvách boli zmietané nahor, ani taká pomalá, aby ohrozila spracovateľskú kapacitu zariadenia.
Počas fázy zahusťovania tvoria pevné častice, ktoré sa hromadia na dne, zhrubnutú vrstvu. Škrabky alebo miešadlá sa pomaly otáčajú pozdĺž dna nádrže, aby rovnomerne dopravili tento zahustený materiál smerom k vypúšťaciemu otvoru, pričom súčasne zabránili tvorbe stagnujúcich zón na dne. Číra kvapalina v hornej vrstve preteká cez prepadovú hrádzu do zberného žľabu, čím sa dosiahne účinná separácia tekutých-tuhých látok. Operátori môžu regulovať rýchlosť zahusťovania a konečnú koncentráciu kalu nastavením parametrov, ako je rýchlosť otáčania škrabky, hladina kvapaliny a rýchlosť podávania zahusťovadla, čím sa zabezpečí, že zariadenie bude pracovať s vysokou účinnosťou pri zachovaní rovnomernosti kalu.
Zahustený kal na dne je kontinuálne vypúšťaný škrabkami a dopravovaný do ďalšej fázy procesu-, ako je likvidácia hlušiny, filtrácia alebo prečerpávanie do skladovacej nádrže kalu. Súčasne môže byť číra prepadová kvapalina z hornej vrstvy zahusťovadla buď regenerovaná alebo vypúšťaná. Celý proces zvyčajne prebieha nepretržite; prostredníctvom cyklickej sekvencie kontinuálneho privádzania, usadzovania, zahusťovania a vypúšťania zariadenie dosahuje efektívnu koncentráciu pevných častíc v suspenzii a separáciu čírej kvapalnej fázy. Okrem toho optimalizáciou prevádzkových parametrov a rozumným pridávaním flokulantov je možné urýchliť rýchlosť usadzovania a znížiť zákal čírej kvapaliny, čím sa uspokoja špecifické požiadavky rôznych výrobných procesov.
